La encuadernación ha sido realizada, de manera artesanal, en marroquín negro. Destaca por su exuberante ornamentación estampada en oro, tanto en las tapas como en los contracantos y el lomo. En los entrenervios se puede leer el nombre del autor (Mattioli), la palabra «herbario» y el nombre de la biblioteca y la signatura, estampadas en oro.